Сохранения Noita лежат стандартно в OC Windows 10 на локальном диске (C:) по такому пути:

C:Users[имя_пользователя]AppDataLocalLowNolla_Games_Noita

Путь где находятся сейвы Noita в OC Linux:

Steam Play Proton: ~/.steam/steam/userdata/[id_пользователя]/881100/